تكللت الزراعة بالنجاح وتم وضع التركيبة، ولكن بعد مرور أشهر أو سنوات على استخدام الزرعة وظيفياً بدأت تظهر المشاكل في منطقة الزراعة، ومسببات الفشل في هذه المرحلة هي

١- تجمع الترسبات الجيرية وبقايا الطعام على سطح الزرعة والتاج بسبب عدم الالتزام بتعليمات نظافة الفم والأسنان والزيارة الدورية لطبيب الأسنان للقيام بتنظيف اللثة والأسنان دورياً كل ثلاثة إلى أربعة أشهر. فتتسبب البكتيريا بذوبان العظم المحيط بالزرعة وفشل الزرعة تدريجياً

٢- استخدام الزرعة لمضغ الأطعمة شديدة القسوة بشكل متكرر، مما يؤدي لإصابة العظم بضغط عالي مباشر يؤدي إلى ذوبان العظم وفشل الزرعة تدريجياً. وفي بعض الحالات قد يؤدي إلى كسر معدن الزرعة داخل العظم والاضطرار لإزالتها جراحياً

٣- تصميم التاج / التركيبات بشكل خاطئ من قبل الطبيب، مما قد يتسبب بالضغط على العظم بشكل كبير أو خلق مناطق بين الأسنان يستحيل تنظيفها بشكل كامل يومياً، وبالتالي تفشل الزرعة تدريجياً